تبدأ مرحلة التنفيذ في الحصول على الموافقة على الخطة والبدء بالتطبيق من خلال تطوير خارطة إستراتيجية وخطة تشغيلية وهذه تعتبر من أكبر التحديات التي تواجه الجامعة والقدرة على تنفيذ الخطة الإستراتيجية.
أصبح تحقيق الرؤية لا يعتمد على وجود الخطة الإستراتيجية فقط وإنما يعتمد على قدرة الجامعة على تجهيز خطة تشغيلية لتنفيذ الخطة الإستراتيجية بكل كفاءة.
تشمل عملية التخطيط إعداد مؤشرات لقياس الأداء وإدارة المبادرات الإستراتيجية لمعرفة الأولويات للتنفيذ وتحديد الفجوات ثم قياس الأداء ورفع التقارير عن الأهداف والمؤشرات والمحاور والمبادرات الإستراتيجية.
حسن الظن بالله تعالى؛ هو قوة اليقين بما وعد الله تعالى عباده من سعة كرمه ورحمته، ورجاء حصول ذلك.
لتحقيق القيم المضافة علينا أن نعرف العمليات التي يجب أن نبدع فيها وحتى نبدع علينا معرفة الاحتياجات الواجب توفرها من بنية تحتية، وهذا يتطلب توفر موارد مالية تدار بفعالية لتحقيق الأهداف المرجوة.
المكونات الرئيسية للخطة الاستراتيجية لتتضمن الرؤية والرسالة والقيم والغايات التي تسعى إليها المؤسسة لتحقيق الأهداف والقيمة المضافة للمتعاملين المعنيين والتي يجب أن تتوفر لتحقيق الغايات الإستراتيجية
عملية التحليل ودراسة الواقع من خلال معرفة نقاط القوة والضعف وتحديد الفرص المتاحة والتحديات ومعرفة المخاطر التي قد تتعرض لها، وكذلك تحليل آراء المستفيدين من داخل الجامعة وخارجها،
عملية التخطيط تتضمن مرحلتين: مرحلة الإعداد ومرحلة التنفيذ، وتبدأ مرحلة الإعداد بالتنظيم والتجهيز من خلال تشكيل فريق للعمل وتوقيع اتفاقيات وعرض خطة واضحة للوصول إلى الأهداف المرسومة بإذن الله تعالى.
